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一级学科代码及名称：0831 生物医学工程（2007年）
本一级学科在全国高校中具有“博士一级”授权的单位共30个，本次参评18个；还有6个具有“硕士一级”授权的单位也参加了本次评估。参评高校共24所。
| 学校代码及名称 | 整体水平 | |
| 排名 | 得分 | |
| 10286 东南大学 | 1 | 93 |
| 10248 上海交通大学 | 2 | 87 |
| 10610 四川大学 | 3 | 86 |
| 10335 浙江大学 | 4 | 82 |
| 10487 华中科技大学 | 5 | 81 |
| 10698 西安交通大学 | ||
| 10003 清华大学 | 7 | 79 |
| 10246 复旦大学 | 8 | 78 |
| 10611 重庆大学 | ||
| 10056 天津大学 | 10 | 76 |
| 10247 同济大学 | 11 | 73 |
| 10614 电子科技大学 | 12 | 71 |
| 10005 北京工业大学 | 13 | 70 |
| 10532 湖南大学 | ||
| 10533 中南大学 | ||
| 90032 第四军医大学 | 16 | 68 |
| 10631 重庆医科大学 | 17 | 66 |
| 12121 南方医科大学 | ||
| 10007 北京理工大学 | 19 | 65 |
| 10112 太原理工大学 | 20 | 64 |
| 10142 沈阳工业大学 | 21 | 63 |
| 10110 中北大学 | 22 | 61 |
| 10217 哈尔滨工程大学 | ||
| 10312 南京医科大学 | 24 | 60 |
